Скидки ставятся через раздел цен и скидок, но если сейчас ничего не грузится, проблема, скорее всего, в зависшей загрузке файла или временном сбое кабинета. Попробуйте загрузить шаблон только с нужными артикулами и проверьте статус обработки в истории.
