Порог цены задается Яндексом. И я не знаю по каким критериям. Возможно он просто не обновляет данные либо они изначально ошибочные.
У нас есть товары для которых рекомендованная цена примерно в 2 раза меньше нашей. Она ниже цены по которой сам поставщик