Уточните этап операции, проверьте настройки карточки, логистики и ограничения площадки, затем сверяйте результат по отчетам и журналу изменений. Для вашего случая проверьте: знает, занулить, остатки, через. Проверьте историю изменений и исключите конфликт между ручными и автонастройками.